De NVKF neemt deel aan de Federatie Medisch Specialisten. Zij is vertegenwoordigd in de Algemene Vergadering (vertegenwoordiging door Lieke Poot, voorzitter) en in diverse raden van de Federatie:
Raad Kwaliteit, vertegenwoordiging door Maarten Foppes
Raad Opleiding, vertegenwoordiging door Christian van Swol en Erwin Baas
Raad Wetenschap & Innovatie, vertegenwoordiging door Herke Jan Noordmans en Carola van Pul
Raad Beroepsbelangen, vertegenwoordiging door Vera Lagerburg en Walter Kool